TFARM

DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见TFARM．

转录因子关联规则矿工

Bioconductor版本:3.14

它在特定的基因组区域中寻找转录因子与转录因子靶标的相关关联。它还允许评估关联规则中转录因子(以及转录因子组合)的重要性指数分布。

作者:Liuba Nausicaa Martino, Alice Parodi, Gaia Ceddia, Piercesare Secchi, Stefano Campaner, Marco Masseroli

维护者:Liuba Nausicaa Martino

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TFARM”)

PDF	R脚本	转录因子关联规则挖掘器
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，基础设施，软件，StatisticalMethod，转录
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	arules，字段，GenomicRanges、图形、stringr，方法，统计，gplots
链接
建议	BiocStyle，knitr，plyr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TFARM_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	TFARM_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TFARM_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFARM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TFARM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TFARM/
软件包下载报告	下载数据