TreeSummarizedExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.TreeSummarizedExperiment

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见TreeSummarizedExperiment．

tresummarizeexperiment:一个S4类的树状结构数据

Bioconductor版本:3.14

treesummarizeexperiment扩展了singlecel实验，以包括矩形数据的行或列上的分层信息。

作者:黄瑞珠[aut, cre]，恩斯特[ctb]

维护人员:Ruizhu Huang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" treesummarizeexperimental ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TreeSummarizedExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	1.树木简介
超文本标记语言	R脚本	2.结合的传染性海绵状脑病
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	2.2.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.6.0)，SingleCellExperiment，S4Vectors(> = 0.23.18),Biostrings
进口	方法,BiocGenerics跑龙套,猿，rlang，dplyr，SummarizedExperiment，BiocParallel，IRanges，treeio
链接
建议	ggtree，ggplot2，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	curatedMetagenomicData，ExperimentSubset，米娅，miaViz，microbiomeDataSets
进口我
建议我	philr
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TreeSummarizedExperiment_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	TreeSummarizedExperiment_2.2.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	TreeSummarizedExperiment_2.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TreeSummarizedExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ treesummarizeexperiment
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TreeSummarizedExperiment/
软件包下载报告	下载数据