biodbKegg

DOI:10.18129 / B9.bioc.biodbKegg

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biodbKegg。

biodbKegg、图书馆KEGG数据库连接

Bioconductor版本:3.14

biodb biodbKegg图书馆是一个扩展的框架方案,提供访问KEGG数据库复合酶,基因,模块,Orthology和反应。它允许加入检索条目的数量。Web服务,如“发现”,“列表”和“findExactMass”也可以。一些功能导航路径也已经实现。

作者:Pierrick罗杰(aut (cre)

维护人员:Pierrick罗杰< Pierrick。罗杰在cea.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biodbKegg”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biodbKegg”)

HTML	R脚本	介绍biodbKegg包。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,KEGG,通路,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	R6,biodb(> = 1.1.9),嗯,生命周期
链接
建议	BiocStyle,roxygen2,devtools,testthat(> = 2.0.0),knitr,rmarkdown,igraph,魔法,lgr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pkrog/biodbKegg
BugReports	https://github.com/pkrog/biodbKegg/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	biodbKegg_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	biodbKegg_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	biodbKegg_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbKegg
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biodbKegg
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/biodbKegg/
包下载报告	下载数据