cellity

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellity

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见cellity

单细胞rna序列数据的质量控制

Bioconductor版本:3.14

支持向量机方法识别和过滤低质量细胞从单细胞RNA-seq数据集。

作者:Tomislav Illicic, Davis McCarthy

维护者:Tomislav Ilicic

引文(从R内,输入引用(“cellity”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cellity”)

超文本标记语言 R脚本 介绍cellity包
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文本 新闻

细节

biocViews DimensionReductionGeneExpressionImmunoOncology归一化预处理质量控制RNASeq测序软件SupportVectorMachine转录组可视化
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.3)
进口 AnnotationDbie1071ggplot2,图形,grDevices,网格,mvoutlierorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbrobustbase统计数据,topGO,跑龙套
链接
建议 BiocStyle脱字符号knitrtestthatrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 cellity_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 cellity_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) cellity_1.22.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cellity
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/cellity/
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