clonotypeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.clonotypeR

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见clonotypeR．

T细胞抗原受体序列高通量分析

Bioconductor版本:3.14

T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的，产生了巨大的V， (D)和J片段的组合。重组过程中的附加过程在V和J段之间产生额外的序列多样性。总的来说，这个高度可变的区域被称为CDR3循环。该软件包的目的是处理和定量分析来自多个序列库的数百万个V-CDR3-J组合，称为克隆型。

作者:Charles Plessy < Charles。普莱西在oist。jp>

维护者:Charles Plessy < Charles。普莱西在oist。jp>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“clonotypeR”)

超文本标记语言	R脚本	clonotypeR用户指南
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件
版本	1.32.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(8.5年)
许可证	文件许可证
取决于
进口	方法
链接
建议	BiocGenerics，刨边机，knitr，pvclust，rmarkdown，RUnit，素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL	http://clonotyper.branchable.com/
BugReports	http://clonotyper.branchable.com/Bugs/
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	clonotypeR_1.32.1.tar.gz
Windows二进制	clonotypeR_1.32.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	clonotypeR_1.32.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clonotypeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/clonotypeR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/clonotypeR/
软件包下载报告	下载数据