cosmosR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmosR

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见cosmosR．

COSMOS(因果导向的多组空间搜索)

Bioconductor版本:3.14

COSMOS(因果导向的多组空间搜索)是一种基于信号、代谢和基因调控网络的先验知识，集成磷蛋白组学、转录组学和代谢组学数据集的方法。它估计了转录因子和激酶的活性，并发现了网络水平的因果推理。因此，COSMOS为跨多组学数据集的实验观测提供了机制假设。

作者:Aurélien Dugourd [aut]，阿提拉·加博尔[au]， Katharina Zirngibl [cre, aut]

维护者:Katharina Zirngibl < Katharina。在uni-heidelberg.de>锆石

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“cosmosR”)

超文本标记语言	R脚本	cosmosR教程
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细节

biocViews	CellBiology，GeneSignaling，代谢组学，网络，通路，蛋白质组学，软件，转录组
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1)
进口	AnnotationDbi，biomaRt，狂欢节，多萝西娅，dplyr，ggplot2，GSEABase，igraph，magrittr，org.Hs.eg.db，plyr，purrr，readr，rlang，尺度，stringr，宠物猫跑龙套,visNetwork
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，钢琴
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/saezlab/COSMOSR
BugReports	https://github.com/saezlab/COSMOSR/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	cosmosR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	cosmosR_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cosmosR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmosR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cosmosR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cosmosR/
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