ctsGE

DOI:10.18129 / B9.bioc.ctsGE

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见ctsGE

时间序列基因表达数据的聚类

Bioconductor版本:3.14

时间序列数据集中潜在的许多预测变量(如基因等)的监督聚类方法提供了帮助用户将基因分配到预定义的模型配置文件集的功能。

作者:Michal Sharabi-Schwager [aut, cre], Ron Ophir [aut]

维护者:Michal Sharabi-Schwager

引文(从R内,输入引用(“ctsGE”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ctsGE”)

超文本标记语言 R脚本 ctsGE包
PDF 参考手册

细节

biocViews 贝叶斯聚类DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichment遗传学ImmunoOncologyRNASeq测序软件TimeCourse转录
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.2)
进口 ccaPPggplot2limmareshape2闪亮的统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议 BiocStyledplyrDTGEOqueryknitr老鸨rmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/michalsharabi/ctsGE
BugReports https://github.com/michalsharabi/ctsGE/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 ctsGE_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 ctsGE_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ctsGE_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ctsGE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ctsGE
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ctsGE/
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