drugTargetInteractions

DOI:10.18129 / B9.bioc.drugTargetInteractions

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见drugTargetInteractions．

药物相互作用

Bioconductor版本:3.14

提供用于识别小分子或基因/蛋白质标识符集的药物-靶点相互作用的实用程序。所需的药物-靶点相互作用信息从ChEMBL数据库的本地SQLite实例获得。ChEMBL被选择用于此目的，因为它为公共领域的药物靶点信息提供了最全面和最好的注释知识资源之一。

作者:Thomas Girke [cre, aut]

维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“drugTargetInteractions”)

超文本标记语言	R脚本	药物相互作用
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，Cheminformatics，代谢组学，遗传药理学，药物基因组学，蛋白质组学，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法，R (>= 4.1)
进口	跑龙套,RSQLite，UniProt.ws，biomaRt，ensembldb，BiocFileCache，dplyr，rappdirs，AnnotationFilter，S4Vectors
链接
建议	RUnit，BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2，reshape2，DT，EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
BugReports	https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	drugTargetInteractions_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	drugTargetInteractions_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/drugTargetInteractions
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/drugTargetInteractions/
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