eiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.eiR

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见eiR

加速小分子的相似性搜索

Bioconductor版本:3.14

eiR包提供了使用嵌入和索引方法对非常大的小分子数据集进行加速结构相似性搜索的实用工具。

作者:凯文·霍兰、曹益群、泰勒·巴克曼

维护者:托马斯·吉克<托马斯。网址ucr。edu>

引用(来自R,输入引用(eiR)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("eiR")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes (eiR)

超文本标记语言 R脚本 小分子的加速相似性搜索
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文本 许可证

细节

biocViews BiomedicalInformaticsCellBasedAssaysCheminformatics聚类DataImport基础设施代谢组学MicrotitrePlateAssay遗传药理学药物基因组学蛋白质组学软件可视化
版本 1.34.0
在Bioconductor中 BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10.0),ChemmineR(>= 2.15.15),方法DBI
进口 、工具、降雪RUnit、方法、ChemmineRRCurl消化BiocGenericsRcppAnnoy(> = 0.0.9)
链接
建议 BiocStyleknitcitationsknitrknitrBootstraprmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/girke-lab/eiR
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 eiR_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 eiR_1.34.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra) eiR_1.34.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/eiR
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/eiR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/eiR/
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