此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见epistack.
Bioconductor版本:3.14
书信体包的主要目标是基因组轨迹堆栈的可视化(如,但不限于,ChIP-seq, ATAC-seq, DNA甲基化或基因组守恒数据)集中在感兴趣的基因组区域。
作者:SACI Safia [aut], DEVAILLY Guillaume [cre]
维护者:DEVAILLY Guillaume
引文(从R内,输入引用(“epistack”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“epistack”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用epistack |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ChIPSeq,GeneExpression,预处理,RNASeq,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | GenomicRanges,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,viridisLite、图形、plotrix, grDevices, stats |
链接 | |
建议 | testthat(> = 3.0.0),BiocStyle,knitr,rmarkdown,EnrichedHeatmap,biomaRt,rtracklayer,covr,vdiffr,魔法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | epistack_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | epistack_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | epistack_1.0.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epistack |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/epistack/ |
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