epistack

DOI:10.18129 / B9.bioc.epistack

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见epistack

来自表观遗传信号的堆栈剖面热图

Bioconductor版本:3.14

书信体包的主要目标是基因组轨迹堆栈的可视化(如,但不限于,ChIP-seq, ATAC-seq, DNA甲基化或基因组守恒数据)集中在感兴趣的基因组区域。

作者:SACI Safia [aut], DEVAILLY Guillaume [cre]

维护者:DEVAILLY Guillaume

引文(从R内,输入引用(“epistack”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“epistack”)

超文本标记语言 R脚本 使用epistack
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ChIPSeqGeneExpression预处理RNASeq软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.1)
进口 GenomicRangesBiocGenericsS4VectorsIRangesviridisLite、图形、plotrix, grDevices, stats
链接
建议 testthat(> = 3.0.0),BiocStyleknitrrmarkdownEnrichedHeatmapbiomaRtrtracklayercovrvdiffr魔法
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 epistack_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 epistack_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) epistack_1.0.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epistack
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/epistack/
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