gmoviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.gmoviz

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见gmoviz．

转基因生物和编辑细胞系中复杂基因组变异的无缝可视化

Bioconductor版本:3.14

转基因生物(GMOs)和细胞系是各种生物研究中广泛使用的模型。作为这些模型特征的一部分，DNA测序技术和生物信息学分析被系统地用于研究它们的基因组。因此，产生了大量的数据，并应用了各种算法来分析这些数据，这对以信息丰富和简洁的方式表示所有发现提出了挑战。“gmoviz”为用户提供了一种简单的方法，可以在更大的生物学相关规模上可视化和促进复杂的基因组编辑事件的解释。

作者:Kathleen Zeglinski [cre, aut]， Arthur Hsu [aut]， Monther Alhamdoosh [aut]，康斯坦丁诺斯·库茨基斯[au]

维护者:Kathleen Zeglinski < Kathleen。Zeglinski在csl.com.au>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gmoviz”)

超文本标记语言	R脚本	gmoviz的高级用法
超文本标记语言	R脚本	gmoviz简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,GeneticVariability,GenomicVariation,测序,软件,可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	circlize,GenomicRanges，图形，R (>= 4.0)
进口	网格,gridBase,Rsamtools,ComplexHeatmap,BiocGenerics,Biostrings,GenomeInfoDb、方法、GenomicAlignments,GenomicFeatures,IRanges,rtracklayer,pracma,色彩,S4Vectors
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,pasillaBamSubset,BiocStyle,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	gmoviz_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	gmoviz_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gmoviz_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmoviz
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gmoviz
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gmoviz/
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