石墨

DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅石墨。

从路径拓扑图形交互环境

Bioconductor版本:3.14

从路径图对象拓扑来源于KEGG,豹,PathBank,网页,Reactome SMPDB和WikiPathways数据库。

作者:Gabriele销售(cre),艾瑞卡Calura (aut),奇亚拉Romualdi (aut)

维护人员:Gabriele销售< Gabriele。销售unipd.it >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“石墨”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(石墨)

PDF	R脚本	从路径拓扑图形交互环境
PDF		metabolites.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GraphAndNetwork,KEGG,代谢组学,网络,通路,Reactome,软件,ThirdPartyClient
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	AGPL-3
取决于	R(> = 4.1),方法
进口	AnnotationDbi,使彻底失败,图(> = 1.67.1),httr,rappdirs,统计,跑龙套,图形
链接
建议	a4Preproc,所有,BiocStyle,限幅器,codetools,hgu133plus2.db,hgu95av2.db,嫁祸于,knitr,org.Hs.eg.db平行,R.rsp,RCy3,rmarkdown,SPIA(> = 2.2),testthat,topologyGSA(> = 1.4.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	PoTRA
进口我	dce,EnrichmentBrowser,mogsa,multiGSEA,ReactomePA,StarBioTrek
建议我	限幅器,InterCellar,metaboliteIDmapping
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	graphite_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	graphite_1.40.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	graphite_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/石墨
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/graphite/
包下载报告	下载数据