此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见杂环胺.
Bioconductor版本:3.14
该软件包为用户提供了查询人类细胞图谱数据存储库的单细胞实验数据的能力。' projects() ', ' files() ', ' samples() '和' bundles() '函数检索这些索引的摘要信息;对应的' *_details() '可用于每个索引的单个条目。可以使用' files_download() '下载基于文件的资源。该包的高级使用允许用户对大型结果集进行分页,并灵活地查询表示查询响应的“列表的列表”结构。
作者:Maya McDaniel [aut], Martin Morgan [aut, cre]
维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(hca)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (hca)
超文本标记语言 | R脚本 | 访问人类细胞图谱数据 |
超文本标记语言 | R脚本 | 研究人类细胞图谱 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | SingleCell,软件 |
版本 | 1.2.3 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | httr,jsonlite,dplyr,宠物猫,tidyr,readr,BiocFileCache,工具,utils,消化 |
链接 | |
建议 | futile.logger,LoomExperiment,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,S4Vectors、方法、testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | hca_1.2.3.tar.gz |
Windows二进制 | hca_1.2.3.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | hca_1.2.3.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hca |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hca |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/hca/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: