loci2path

DOI:10.18129 / B9.bioc.loci2path

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅loci2path。

Loci2path:监管注释基因间隔基于组织表达法

Bioconductor版本:3.14

loci2path执行statistics-rigorous浓缩eQTLs基因组分析感兴趣的区域。使用eQTL Genotype-Tissue表达式(GTEx)项目提供的集合,从MSigDB路径集合。

作者:Tianlei徐

维护人员:徐Tianlei < Tianlei。徐:emory.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“loci2path”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“loci2path”)

HTML	R脚本	loci2path
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BioCarta,报道,FunctionalGenomics,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,测序,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	pheatmap,wordcloud,RColorBrewer,data.table、方法、grDevices统计数据、图形、GenomicRanges,BiocParallel,S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/StanleyXu/loci2path
BugReports	https://github.com/StanleyXu/loci2path/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	loci2path_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	loci2path_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	loci2path_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ loci2path
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/loci2path/
包下载报告	下载数据