moanin

DOI:10.18129 / B9.bioc.moanin

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见moanin。

时序RNASeq数据分析的R包

Bioconductor版本:3.14

简单和有效的工作流程的时间过程基因表达数据，建立在公开可用的开源项目托管在CRAN和bioconductor。Moanin为使用功能数据分析分析时间过程数据所需的所有步骤提供辅助函数:(1)时间过程数据的功能建模;(2)差异表达分析;(3)聚类;(4)下游分析。

作者:Elizabeth Purdom [aut]奈尔·瓦洛柯[法语，法语]

维护者:奈尔·瓦罗夸克斯<奈尔。Varoquaux在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("moanin")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“moanin”)

超文本标记语言	R脚本	呻吟包
PDF		参考手册
文本		自述
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，RNASeq，软件，TimeCourse
版本	1.2.0
在Bioconductor中	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	BSD 3-clause License +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，topGO,统计数据
进口	S4Vectors，质量(> = 1.0.0),limma，冬青，刨边机、图形、方法、grDevices、reshape2，敝中断，动物园，ClusterR样条函数,matrixStats
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),timecoursedata，knitr，rmarkdown，减价，covr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	moanin_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	moanin_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	moanin_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/moanin
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/moanin
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/moanin/
软件包下载报告	下载数据