mosbi

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosbi

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见mosbi。

基于双聚类的分子特征识别

Bioconductor版本:3.14

该包实现了双聚类集成方法MoSBi (Molecular signature Identification from bicclustering)。MoSBi为双聚类结果提供了标准化的接口，并可以将其结果与多算法集成方法结合起来，在分子组学数据上计算鲁棒的集成双聚类。这是通过计算双聚类的相似性网络和使用自定义错误模型过滤重叠来完成的。然后，利用鲁万模块性从相似网络中提取双聚类群落，然后将其转化为集合双聚类。此外，MoSBi还包括几种网络可视化方法，以提供直观和可扩展的结果概述。MoSBi附带了几个双聚类算法，但可以很容易地扩展到新的双聚类算法。

作者:蒂姆·丹尼尔·罗斯，约施·康斯坦丁·鲍林

维护者:Tim Daniel Rose < Tim。罗斯在wzw.tum.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mosbi")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“mosbi”)

超文本标记语言	R脚本	样例流程
超文本标记语言	R脚本	similarity-metrics-evaluation
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，网络，软件，StatisticalMethod
版本	1．0．3
在Bioconductor中	BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月)
许可证	AGPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	Rcpp，黑洞，xml2、方法、igraph，fabia。，RcppParallel，biclust，isa2，QUBIC，akmbiclust，RColorBrewer
链接	Rcpp，黑洞，RcppParallel
建议	knitr，rmarkdown，BiocGenerics，runibic，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements	c++ 17, GNU制作
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	mosbi_1.0.3.tar.gz
Windows二进制	mosbi_1.0.3.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	mosbi_1.0.3.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosbi
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosbi
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mosbi/
软件包下载报告	下载数据