mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见mzID

R的mzIdentML解析器

Bioconductor版本:3.14

使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用,能够处理所有类型的mzIdentML文件,缺点是输出比特定于供应商的解析器更“漂亮”。如果有任何问题,请与维护人员联系,并提供一个mzIdentML文件,以便快速解决问题。

作者:Laurent Gatto [ctb, cre]——托马斯·佩德森[au],佩尤克[ctb]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

引文(从R内,输入引用(“mzID”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“mzID”)

PDF R脚本 使用mzID
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportImmunoOncologyMassSpectrometry蛋白质组学软件
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(8.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法
进口 XMLplyr平行,doParallelforeach迭代器ProtGenerics
链接
建议 knitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 蛋白质组学
进口我 MSGFguiMSGFplusMSnbaseMSnIDTargetDecoy
建议我 mzRRforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 mzID_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 mzID_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) mzID_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mzID
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/mzID/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: