此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见mzID.
Bioconductor版本:3.14
使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用,能够处理所有类型的mzIdentML文件,缺点是输出比特定于供应商的解析器更“漂亮”。如果有任何问题,请与维护人员联系,并提供一个mzIdentML文件,以便快速解决问题。
作者:Laurent Gatto [ctb, cre]——托马斯·佩德森[au],佩尤克[ctb]
维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>
引文(从R内,输入引用(“mzID”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“mzID”)
R脚本 | 使用mzID | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.32.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(8.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法 |
进口 | XML,plyr平行,doParallel,foreach,迭代器,ProtGenerics |
链接 | |
建议 | knitr,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 蛋白质组学 |
进口我 | MSGFgui,MSGFplus,MSnbase,MSnID,TargetDecoy |
建议我 | mzR,RforProteomics |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | mzID_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | mzID_1.32.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | mzID_1.32.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mzID |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/mzID/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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