plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见plyranges。

操作GenomicRanges的流畅接口

Bioconductor版本:3.14

一个类似于dplyr的接口，用于与常见的Bioconductor类Ranges和GenomicRanges进行交互。通过提供一种语法和一致的方式来操作这些类，它们对新的Bioconductor用户的可访问性有望增加。

作者:斯图尔特·李(Stuart Lee)、迈克尔·劳伦斯、黛安·库克、斯宾塞·奈斯特罗姆、斯宾塞·奈斯特罗姆

维护者:Stuart Lee < Stuart .andrew。Lee在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("plyranges")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“plyranges”)

超文本标记语言	R脚本	介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DataRepresentation，基础设施，软件，WorkflowStep
版本	1.14.0
在Bioconductor中	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，BiocGenerics，IRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口	方法,dplyr，rlang(> = 0.2.0),magrittr，tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，Rsamtools，S4Vectors(>= 0.23.10)
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，testthat(> =魅惑,HelloRanges，HelloRangesData，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，pasillaBamSubset，covr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sa-lee/plyranges
这取决于我
进口我	BUSpaRse，dasper，fluentGenomics，InPAS，methylCC，multicrispr，nearBynding，nullranges，plotgardener
建议我	模因，svaNUMT，svaRetro
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	plyranges_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	plyranges_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	plyranges_1.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/plyranges
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/plyranges/
软件包下载报告	下载数据