predictionet

DOI:10.18129 / B9.bioc.predictionet

这个包是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.14版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见predictionet．

为(但不限于)基因组数据设计的预测网络的推理

Bioconductor版本:3.14

该软件包包含一组与网络推理相关的功能，结合了从生物医学文献和结构化生物数据库中提取的基因组数据和先验信息。主要功能是能够使用贝叶斯或基于回归的推理方法生成网络;前者受限于< 100个变量，而后者可以推断包含数百个变量的网络。为了帮助用户关注高质量的子网络，在边缘和节点级别实现了一些统计(边缘稳定性，每个节点的预测能力，…)。最终，这个包被用于由Dana-Farber癌症研究所与Entagen合作开发的“预测网络”web应用程序。

作者:Benjamin Haibe-Kains, Catharina Olsen, Gianluca Bontempi, John Quackenbush

维护者:Benjamin Haibe-Kains ， Catharina Olsen

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("predictionet")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“predictionet”)

PDF	R脚本	predictionet
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	GraphAndNetwork，NetworkInference，软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	igraph，catnet
进口	处罚，RBGL，质量
链接
建议	网络，minet，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://compbio.dfci.harvard.eduhttp://www.ulb.ac.be/di/mlg
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	predictionet_1.40.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	predictionet_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/predictionet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ predictionet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/predictionet/
包下载报告	下载数据