recountmethylation

DOI:10.18129 / B9.bioc.recountmethylation

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见recountmethylation．

访问和分析DNA甲基化数据库汇编

Bioconductor版本:3.14

访问DNA甲基化阵列数据库的交叉研究汇编。可以使用提供的函数下载和访问数据库文件。关于数据库文件类型(HDF5和HDF5- summarizeexperiment)、summarizeexperiment类以及数据处理、验证和分析的示例的背景信息，可以在包的小插图中找到。欧洲杯2021体育彩票注意对包装负载的免责声明，并为进一步的信息咨询主要手稿。

作者:Sean K Maden [cre, aut]——里德·F·汤普森[作家]——卡斯珀·D·汉森[au]，阿比纳夫·内洛尔[au]

维护者:Sean K Maden < Maden at ohsu.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“recountmethylation”)

超文本标记语言	R脚本	数据分析
超文本标记语言	R脚本	从DNAm阵列确定种群祖先
超文本标记语言	R脚本	DNAm阵列的最近邻分析
超文本标记语言	R脚本	DNAm阵列的功率分析
超文本标记语言	R脚本	叙述甲基化用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，表观遗传学，ExperimentHub，MethylationArray，微阵列，软件
版本	1.4.5
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)
进口	minfi，HDF5Array，rhdf5，S4Vectors， utils，方法，RCurl，R.utils，BiocFileCache，IlluminaHumanMethylation450kmanifest
链接
建议	knitr，testthat，ggplot2，gridExtra，rmarkdown，BiocStyle，GenomicRanges，limma，ExperimentHub，AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/metamaden/recountmethylation
BugReports	https://github.com/metamaden/recountmethylation/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	recountmethylation_1.4.5.tar.gz
Windows二进制	recountmethylation_1.4.5.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	recountmethylation_1.4.5.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/recountmethylation
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ recretmethylation
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/recountmethylation/
软件包下载报告	下载数据