此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见rnaseqcomp.
Bioconductor版本:3.14
RNA-seq定量管道的几个定量和可视化基准。为了进行评估,每个管道对基因、转录本、连接或外显子的双条件量化应组织成数字矩阵。
作者:滕明祥,Rafael A. Irizarry
维护人员:Mingxiang Teng
引文(从R内,输入引用(“rnaseqcomp”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rnaseqcomp”)
超文本标记语言 | R脚本 | rnaseqcomp用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 质量控制,RNASeq,软件,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.2.0) |
进口 | RColorBrewer、方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/tengmx/rnaseqcomp |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | SummarizedBenchmark |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | rnaseqcomp_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | rnaseqcomp_1.24.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | rnaseqcomp_1.24.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqcomp |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaseqcomp |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/rnaseqcomp/ |
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