rnaseqcomp

DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaseqcomp

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见rnaseqcomp

RNA-seq定量管道的基准

Bioconductor版本:3.14

RNA-seq定量管道的几个定量和可视化基准。为了进行评估,每个管道对基因、转录本、连接或外显子的双条件量化应组织成数字矩阵。

作者:滕明祥,Rafael A. Irizarry

维护人员:Mingxiang Teng

引文(从R内,输入引用(“rnaseqcomp”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rnaseqcomp”)

超文本标记语言 R脚本 rnaseqcomp用户指南
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文本 新闻

细节

biocViews 质量控制RNASeq软件可视化
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.2.0)
进口 RColorBrewer、方法
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/tengmx/rnaseqcomp
全靠我
进口我
建议我 SummarizedBenchmark
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 rnaseqcomp_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 rnaseqcomp_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) rnaseqcomp_1.24.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqcomp
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaseqcomp
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/rnaseqcomp/
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