安全

DOI:10.18129 / B9.bioc.safe

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅安全

意义的分析功能和表达

Bioconductor版本:3.14

安全是一个resampling-based方法检测基因表达的功能分类实验。安全可以应用于2-sample和多层次的比较,或简单线性回归。其他实验设计也可以适应通过用户定义的函数。

作者:威廉·t·巴里

维护人员:路德维希Geistlinger < ludwig_geistlinger hms.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“安全”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“安全”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“安全”)

PDF R脚本 安全手册
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod
版本 3.34.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(> =测试盒框),AnnotationDbi,Biobase、方法、SparseM
进口
链接
建议 GO.db,PFAM.db,reactome.db,hgu133a.db,breastCancerUPP,生存,foreach,doRNG,Rgraphviz,GOstats
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 PCGSE
进口我 EGSEA,EnrichmentBrowser
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 safe_3.34.0.tar.gz
Windows二进制 safe_3.34.0.zip
macOS 10.13(高山脉) safe_3.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/安全
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/safe/
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