土星

DOI:10.18129 / B9.bioc.satuRn

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅土星。

可伸缩的分析微分散装和单细胞RNA-sequencing应用程序记录使用情况

Bioconductor版本:3.14

土星提供了一个胡须高性能、可扩展的框架,用于执行微分成绩单使用分析。包包含三个主要功能。第一个函数、fitDTU适合quasi-binomial广义线性模型,模型记录使用不同群体的利益。第二个函数,testDTU测试感兴趣的团体之间的微分的使用记录。最后,plotDTU可视化使用概要文件的记录组的兴趣。

作者:珀斯吉利·(aut (cre),克里斯汀Vitting-Seerup[所有],柯恩Van den Berge[所有],列文克莱门特(施)

维护人员:珀斯吉利·<珀斯。吉利·在ugent.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“土星”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“土星”)

HTML	R脚本	土星,装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ExperimentalDesign,GeneExpression,MultipleComparison,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	locfdr,SummarizedExperiment,BiocParallel,limma,pbapply,ggplot2,引导,矩阵、数据、方法、图形
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,covr,BiocStyle,AnnotationHub,ensembldb,刨边机,DEXSeq,经验丰富的人,DelayedArray
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/statOmics/satuRn
BugReports	https://github.com/statOmics/satuRn/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	satuRn_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	satuRn_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	satuRn_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/satuRn
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/土星
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/satuRn/
包下载报告	下载数据