scp

DOI:10.18129 / B9.bioc.scp

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见scp．

基于质谱的单细胞蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.14

用于操作、处理和分析基于质谱的单细胞蛋白质组学(SCP)数据的实用函数。该包是为SCP应用程序设计的“QFeatures”包的扩展。

作者:Christophe Vanderaa [aut, cre]，洛朗·加托[au]

维护者:Christophe Vanderaa < Christophe。范德达在uclouvain.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scp”)

超文本标记语言	R脚本	scp的高级用法
超文本标记语言	R脚本	使用readSCP加载数据
超文本标记语言	R脚本	简单来说就是功能
超文本标记语言	R脚本	单细胞蛋白质组学数据处理与分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，GeneExpression，MassSpectrometry，预处理，蛋白质组学，SingleCell，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，QFeatures(> = 1.3.5)
进口	方法，统计，效用，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，MultiAssayExperiment，MsCoreUtils，matrixStats，S4Vectors，dplyr，magrittr，rlang
链接
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，拼接而成，ggplot2，嫁祸于，嘘，股东价值分析，preprocessCore，vsn，uwot
SystemRequirements
增强了
URL	https://UCLouvain-CBIO.github.io/scp
BugReports	https://github.com/UCLouvain-CBIO/scp/issues
全靠我
进口我
建议我	scpdata
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	scp_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	scp_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scp_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scp
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scp
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scp/
软件包下载报告	下载数据