selectKSigs

DOI:10.18129 / B9.bioc.selectKSigs

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见selectKSigs．

使用基于困惑度的测量和交叉验证选择突变特征的数量

Bioconductor版本:3.14

一个通过计算交叉验证的困惑度分数来建议体细胞突变集合中突变签名数量的包。

作者:杨智[aut, cre]，白石雄一[ctb]

维护人员:zhiyang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“selectKSigs”)

超文本标记语言	R脚本	HiLDA的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，测序，软件，SomaticMutation，StatisticalMethod
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)
进口	希尔达，magrittr，gtools、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle，ggplot2，dplyr，tidyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/USCbiostats/selectKSigs
BugReports	https://github.com/USCbiostats/HiLDA/selectKSigs
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	selectKSigs_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	selectKSigs_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	selectKSigs_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/selectKSigs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ selectksig
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/selectKSigs/
软件包下载报告	下载数据