seqLogo

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqLogo

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见seqLogo．

DNA序列比对的序列标识

Bioconductor版本:3.14

seqLogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵，并绘制相应的序列标识，如Schneider和Stephens(1990)所介绍的。

作者:Oliver Bembom [aut]， Robert Ivanek [aut, cre]

维护者:Robert Ivanek < Robert。Ivanek在unibase .ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“seqLogo”)

超文本标记语言	R脚本	DNA序列比对的序列标识
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	SequenceMatching，软件
版本	1.60.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(15年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	方法、网格
进口	stats4, grDevices
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ivanek/seqLogo/issues
全靠我	generegulation，rGADEM
进口我	igvR，感兴趣，PWMEnrich，rGADEM，riboSeqR，scanMiR，分裂，TFBSTools
建议我	BCRANK，DiffLogo，MAGAR，motifcounter，MotifDb，universalmotif
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqLogo_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	seqLogo_1.60.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	seqLogo_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqLogo
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/seqLogo
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/seqLogo/
软件包下载报告	下载数据