紧身

doi：10.18129/b9.bioc.slinky

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.14版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅紧身。

将乐趣放在Lincs L1000数据分析中

生物导体版本：3.14

包装器查询通过Clue.io Rest API获得的L1000元数据以及用于处理Lincs GCTX文件的帮助者，提取有趣的数据集，转换为SummarizedExperiment对象以及执行这些数据集的简化差分表达分析的设施。

作者：Eric Kort [AUT，CRE]

维护者：埃里克·科特（Eric Kort）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Slinky”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Slinky”）

html	R脚本	Lincs分析与Slinky
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，图案表格，，，，软件，，，，第三派对人
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.1）
进口	总结性特征，，，，卷曲，，，，dplyr，，，，foreach，，，，httr，统计，utils，方法，readr，，，，RHDF5，，，，jsonlite，，，，花花公子
链接
建议	Geode，，，，多帕尔，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，GGPLOT2，，，，RTSNE，，，，生物酶，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	slinky_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	slinky_1.12.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Slinky_1.12.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/slinky
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/斜纹
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/slinky/
软件包下载报告	下载统计