一口

DOI:10.18129 / B9.bioc.snifter

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅一口。

R为python包装器openTSNE图书馆

Bioconductor版本:3.14

提供了一个R包装实施FI-tSNE openTNSE从python包。看到Poličar et al。(2019) 和描述的算法出演Linderman et al . (2018) 。

作者:艾伦·奥卡拉汉(aut (cre),亚伦Lun (aut)

维修工:艾伦·奥卡拉汉<阿兰。在outlook.com ocallaghan >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“一口”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“一口”)

HTML	R脚本	介绍了一口
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,测序,SingleCell,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	蛇怪,网状,irlba统计数据,为了
链接
建议	knitr,rmarkdown,scRNAseq,BiocStyle,嘘,食物,天窗,ggplot2,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Alanocallaghan/snifter/issues
取决于我	OSCA.advanced
进口我
建议我	嘘
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	snifter_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	snifter_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	snifter_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snifter
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/一口
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/snifter/
包下载报告	下载数据