waddR

DOI:10.18129 / B9.bioc.waddR

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见waddR。

基于2-Wasserstein距离检测差异分布的统计检验

Bioconductor版本:3.14

该软件包提供基于2-Wasserstein距离的统计检验，用于检测和描述以样本形式给出的两个分布之间的差异。提供了用于计算2-Wasserstein距离和测试差异分布的函数，以及专门针对单细胞RNA测序数据中的差异表达的测试。

作者:Roman Schefzik [aut]， Julian Flesch [cre]

维护者:Julian Flesch

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“waddR”)

超文本标记语言	R脚本	waddR
超文本标记语言	R脚本	wasserstein_metric
超文本标记语言	R脚本	wasserstein_singlecell
超文本标记语言	R脚本	wasserstein_test
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，SingleCell，软件，StatisticalMethod
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	Rcpp(> = 1.0.1),手臂(> = 1.10 1),伊娃，BiocFileCache，BiocParallel，SingleCellExperiment，并行，方法，统计
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	knitr，devtools，testthat，roxygen2，rprojroot，rmarkdown，嘘
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/goncalves-lab/waddR.git
BugReports	https://github.com/goncalves-lab/waddR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	waddR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	waddR_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	waddR_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/waddR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/waddR . zip
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/waddR/
软件包下载报告	下载数据