# # - - - - -设置,包括= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - knitr:: opts_chunk设置美元(崩溃= TRUE,评论= " # >”)图书馆(GCSConnection) gcs_cloud_auth (json_file = NULL) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcs_get_cloud_auth() # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #相当于:<——“genomics-public-data / NA12878.chr20.sample.DeepVariant-0.7.2 # #文件。vcf”文件<——“gs: / / genomics-public-data / NA12878.chr20.sample.DeepVariant-0.7.2。vcf " con < gcs_connection(=描述文件,打开= r) readline (con, n = 2 l)关闭(con) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - file_name <——“NA12878.chr20.sample.DeepVariant-0.7.2。vcf“bucket_name <——“genomics-public-data”反对< - gcs_connection(描述= file_name开放= r,桶= bucket_name) readline (con, n = 2 l)关闭(con) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -这些是等价的# # # # x < - gcs_dir (“gs: / / genomics-public-data / clinvar /”) # # x < - gcs_dir (“genomics-public-data / clinvar /”) x <——gcs_dir (“gs: / / genomics-public-data / clinvar /”) x # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #相当于:x美元README。txt myfile < - x [[" README。txt”]] myfile # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #相当于:myfile美元的. .“myfile [[" . .“]]# # myfile美元“~”myfile[[" ~ "]] # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #相当于:gcs_connection (myfile)反对<——myfile get_connection美元(开放= r)反对关闭(con) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #美元获得文件名myfile file_name # # # #复制文件的目的地,您可以指定一个文件路径,# #或一个文件夹的路径。目的地< -tempdir()美元myfile copy_to(目的地)file.exists (file.path(目的地,myfile file_name)美元)# #删除文件,函数是excutable # #只有当你有权删除该文件。# #使用“安静= TRUE”压制前确认删除该文件。# x美元README。txt美元删除(安静= FALSE) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcs_get_billing_project () gcs_set_billing_project(“项目ID”) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcs_set_requester_pays(真正的)gcs_get_requester_pays () # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcs_get_read_buff () gcs_get_write_buff ()