# # - - - - -设置,包括= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - knitr:: opts_chunk设置美元(崩溃= TRUE,评论= " # >”)# #——bioconductor, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -如果(# !requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) # install.packages (BiocManager) # BiocManager::安装(“HubPub”) # #——负载,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(HubPub) # # - - - - -创造- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - fl < - tempdir () create_pkg(文件。路径(fl、“examplePkg”)、“ExperimentHub”) # # - - - - -资源- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -元数据< - hub_metadata (Title =“编码”,描述=“测试条目”,BiocVersion = " 4.1 ",基因组= NA_character_ SourceType = JSON, SourceUrl = " http://www.encodeproject.org ", SourceVersion = " x.y。z”,物种= NA_character_ TaxonomyId = as.integer (9606), Coordinate_1_based = NA, DataProvider = "编码项目”,维护者= "结核菌素的人 ”,RDataClass = " Rda”, DispatchClass = " Rda”, Location_Prefix = " s3: / / experimenthub /”, RDataPath = " ENCODExplorerData / encode_df_lite。rda”,标签= "编码:智人”)add_resource(文件。路径(fl,“examplePkg”),元数据)# #——read_metadata - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - < -资源文件。路径(fl,“examplePkg”,“本月”、“extdata”,“metadata.csv”)测试< - read.csv(资源)tst # #——发布- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #发布目录与多个文件fl <——tempdir()跑龙套::写作。csv文件(mtcars、文件=。“mtcars1.csv”)路径(fl)跑龙套::写作。csv文件(mtcars、文件=。“mtcars2.csv”)路径(fl) publish_resource (fl,“test_dir”)发布单个文件跑龙套的# #::编写。csv文件(mtcars、文件=。“mtcars3.csv”)路径(fl) publish_resource(文件。路径(fl、“mtcars3.csv”)、“test_dir”) # #——session_info - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()