SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37。

智人SNP定位图(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.14

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因。该信息包使用的源数据文件由NCBI于2015年5月29-30日创建，包含参考基因组GRCh37.p13的snp。警告:请注意，GRCh37。p13基因组是GRCh37的补丁版本。然而，该贴片不会改变1-22、X、Y、MT染色体。GRCh37本身与UCSC的hg19基因组相同，除了线粒体染色体。因此，该包中的snp可以“注入”到BSgenome.Hsapiens.UCSC中。hg19，他们会在正确的位置着陆，但这次注射会排除chrM(即没有任何东西会按这个顺序注射)。

作者:hervevev pag

维护者:H. pageries

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs
版本	0.99.20
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.43.4)
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议	Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我	appreci8R
建议我	AllelicImbalance,GenomicScores,MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5,MafDb.1Kgenomes.phase3.hs37d5,MafDb.ExAC.r1.0.hs37d5,MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.hs37d5,MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5,MafDb.gnomADex.r2.1.hs37d5,MafDb.TOPMed.freeze5.hg19,MungeSumstats,VariantFiltering,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
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包档案

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源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37/
软件包下载报告	下载数据