TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene。

TxDb对象的注释包

Bioconductor版本:3.14

通过将UCSC生成的注释数据库公开为TxDb对象，公开这些数据库

作者:Marc Carlson, Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org> [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，TxDb
版本	3.2.2
许可证	艺术- 2.0
取决于	GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口	AnnotationDbi
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	注释，FDb.InfiniumMethylation.hg19，Homo.sapiens，变体，火神
进口我	阿尔卑斯山脉，appreci8R，ChIPQC，ChIPseeker，decompTumor2Sig，希尔达，musicatk，nearBynding，profileplyr，RareVariantVis，rCGH，UMI4Cats，uncoverappLib
建议我	AllelicImbalance，AnnotationDbi，annotatr，ATACseqQC，beadarray，BiocOncoTK，BiocParallel，biomvRCNS，biovizBase，bumphunter，chipenrich.data，ChIPpeakAnno，chromPlot，cpvSNP，CRISPRseek，derfinder，derfinderPlot，esATAC，弗雷泽，GA4GHclient，GA4GHshiny，计，geneAttribution，《创世纪》，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomicScores，GenVisR，ggbio，gmapR，groHMM，GUIDEseq，gwascat，HTSeqGenie，InPAS，karyoploteR，桅杆，MesKit，MutationalPatterns，NoRCE，先驱者，网页排名，plotgardener，ProteoDisco，PureCN，R3CPET，ramr，regionReport，RiboProfiling，RLSeq，rtracklayer，SGSeq，SigFuge，spatzie，SplicingGraphs，StructuralVariantAnnotation，SummarizedExperiment，svaNUMT，svaRetro，TCGAutils，TFEA。芯片，trackViewer，transcriptR，tximport，VariantAnnotation，VariantFiltering
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包档案

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源包	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene_3.2.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene/
软件包下载报告	下载数据