excluderanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.excluderanges

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见excluderanges。

有问题的基因组区域的基因组坐标

Bioconductor版本:3.14

在处理基因组数据时应避免的有问题的基因组区域的基因组坐标。排除区域(以前称为黑名单)，着丝粒，端粒，已知异染色质区域等的范围(UCSC“差距”表数据)。主要用于人类和小鼠基因组，hg19/hg38和mm9/mm10基因组组装。

作者:米哈伊尔·多兹莫洛夫[作家，作家]，埃里克·戴维斯[奥特]，万森·穆[奥特]，斯图尔特·李[奥特]，蒂姆·特里谢[奥特]，道格拉斯·潘斯蒂尔[奥特]，迈克尔·洛夫[奥特]

维护者:Mikhail Dozmorov < Mikhail。Dozmorov在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("excluderange ")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“excluderanges”)

超文本标记语言	R脚本	excluderanges
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，FunctionalAnnotation，GenomicSequence
版本	0.99.6
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，RefManageR，rmarkdown，rCGH，sessioninfo，AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/mdozmorov/excluderanges
BugReports	https://github.com/mdozmorov/excluderanges/issues
这取决于我
进口我
建议我	nullranges
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	excluderanges_0.99.6.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/excluderanges/
软件包下载报告	下载数据