此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见GSE103322.
Bioconductor版本:3.14
来自18例口腔头颈部鳞状细胞癌患者5902个细胞的单细胞RNA-Seq数据可作为GEO接入[GSE103322] (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE103322)。GSE103322数据已解析为ExperimentHub中可用的sincelel实验对象。
作者:Mariano Alvarez [aut, cre]
维护者:Mariano Alvarez
引文(从R内,输入引用(“GSE103322”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GSE103322”)
超文本标记语言 | R脚本 | scRNASeq HNSC数据使用Bioconductor's ExperimentHub |
参考手册 |
biocViews | CancerData,DNASeqData,ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,SingleCellData |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,GEOquery |
进口 | |
链接 | |
建议 | ExperimentHub(> = 0.99.6),knitr,BiocStyle,rmarkdown,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GSE103322_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSE103322 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSE103322 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GSE103322/ |
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