TENxBUSData

DOI:10.18129 / B9.bioc.TENxBUSData

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见TENxBUSData

单单元数据集从10x在BUS格式

Bioconductor版本:3.14

从R中下载10倍数据集的Barcode, UMI和Set (BUS)格式。这个包附带了BUSpaRse包,它可以将BUS格式作为稀疏矩阵加载到R中,并且具有与使用c++命令行包bustools相关的实用函数。

作者:拉姆达·摩西[作家,作家]

维护者:Lambda Moses

引用(来自R,输入引用(“TENxBUSData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TENxBUSData")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“TENxBUSData”)

超文本标记语言 R脚本 下载总线数据
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataSequencingDataSingleCellData
版本 1.8.0
许可证 BSD_2_clause +文件许可证
取决于
进口 ExperimentHubAnnotationHub跑龙套,BiocGenerics
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/BUStools/TENxBUSData
BugReports https://github.com/BUStools/TENxBUSData/issues
这取决于我
进口我
建议我 BUSpaRse
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 TENxBUSData_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/TENxBUSData
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/TENxBUSData
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TENxBUSData/
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