此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见microbiomeDataSets.
Bioconductor版本:3.14
microbiomeDataSets是Bioconductor'S ExperimentHub基础设施加载的微生物组数据集的集合。这些数据集可作为工作流程和在Bioconductor上发布的微生物组分析工具旁边的小插图的参考。额外的数据集可以随时间添加,欢迎作者的添加。
作者:Leo Lahti [cre, aut],菲利克斯·G.M.恩斯特[au], Sudarshan Shetty [au], Chouaib Benchraka [ctb], Yagmur Simsek [ctb]
维护者:Leo Lahti < Leo。拉赫蒂在iki.fi>
引文(从R内,输入引用(“microbiomeDataSets”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“microbiomeDataSets”)
超文本标记语言 | R脚本 | microbiomeDataSets |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,MicrobiomeData,SequencingData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | CC0 |
取决于 | R (>= 4.1),SummarizedExperiment,TreeSummarizedExperiment,MultiAssayExperiment |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,ExperimentHub,Biostrings,猿 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,SingleCellExperiment,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 米娅,miaViz |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | microbiomeDataSets_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDataSets |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiomeDataSets |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/microbiomeDataSets/ |
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