scpdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.scpdata

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见scpdata

单细胞蛋白质组学数据包

Bioconductor版本:3.14

该软件包传播基于质谱(MS)的单细胞蛋白质组学(SCP)数据集。数据从已发表的作品中收集,并使用“scp”数据结构进行格式化。数据集包含单细胞或分钟样本量的光谱、肽和/或蛋白质水平的定量信息。

作者:Christophe Vanderaa [aut, cre],洛朗·加托[au]

维护者:Christophe Vanderaa < Christophe。范德达在uclouvain.be>

引文(从R内,输入引用(“scpdata”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“scpdata”)

超文本标记语言 R脚本 单细胞蛋白质组学数据包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataMassSpectrometryData蛋白质组ReproducibleResearchSingleCellData
版本 1.2.0
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 4.1),QFeaturesExperimentHub
进口 跑龙套,AnnotationHubSingleCellExperimentS4Vectors
链接
建议 scpmagrittrdplyrknitrBiocStyleBiocCheckrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 scpdata_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scpdata
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scpdata
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/scpdata/
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