tcgaWGBSData.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.tcgaWGBSData.hg19

这个包裹是弃用。它可能会从Bioconductor中移除。请参阅包报废指南了解更多信息。

该软件包适用于Bioconductor的3.14版本。这个包已经从生物导体公司拿走了。有关最新的稳定发布版本,请参见tcgaWGBSData.hg19

数据

Bioconductor版本:3.14

TCGA中WGBS数据的数据包。数据以summarizeexperiment格式存储。参见如何提取数据和执行差异甲基化分析的小插图。

作者:邓康彦

维护者:Divy Kangeyan

引用(来自R,输入引用(“tcgaWGBSData.hg19”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tcgaWGBSData.hg19")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“tcgaWGBSData.hg19”)

超文本标记语言 R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CancerDataExperimentData基因组Homo_sapiens_DataSequencingData
版本 1.12.0
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5.0),ExperimentHub
进口 bsseqknitr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/aryeelab/tcgaWGBSData.hg19/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包 tcgaWGBSData.hg19_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/tcgaWGBSData.hg19
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tcgaWGBSData.hg19
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/tcgaWGBSData.hg19/
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