这个包裹是弃用。它可能会从Bioconductor中移除。请参阅包报废指南了解更多信息。
该软件包适用于Bioconductor的3.14版本。这个包已经从生物导体公司拿走了。有关最新的稳定发布版本,请参见tcgaWGBSData.hg19。
Bioconductor版本:3.14
TCGA中WGBS数据的数据包。数据以summarizeexperiment格式存储。参见如何提取数据和执行差异甲基化分析的小插图。
作者:邓康彦
维护者:Divy Kangeyan
引用(来自R,输入引用(“tcgaWGBSData.hg19”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tcgaWGBSData.hg19")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“tcgaWGBSData.hg19”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CancerData,ExperimentData,基因组,Homo_sapiens_Data,SequencingData |
版本 | 1.12.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5.0),ExperimentHub |
进口 | bsseq,knitr |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/aryeelab/tcgaWGBSData.hg19/issues |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | tcgaWGBSData.hg19_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/tcgaWGBSData.hg19 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/tcgaWGBSData.hg19 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/tcgaWGBSData.hg19/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
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