蛋白质组学

DOI:10.18129 / B9.bioc.proteomics

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见蛋白质组学。

质谱和蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.14

这个工作流程说明了蛋白质组学的R / Bioconductor基础设施。所涵盖的主题集中在支持开放社区驱动的原始数据和识别结果格式、肽谱匹配包、数据处理和分析。

作者:洛朗·加托[aut, cre]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。我想在uclouvain.be b>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("proteomics")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“蛋白质组学”)

超文本标记语言

R脚本

R/Bioc蛋白质组学工作流程

细节

biocViews	ImmunoOncologyWorkflow，ProteomicsWorkflow，工作流
版本	1.18.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，mzR，mzID，MSnID，MSnbase，rpx，MLInterfaces，pRoloc，pRolocdata，的方式，hpar
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/proteomics/
这取决于我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	proteomics_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteomics
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proteomics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/proteomics/
软件包下载报告	下载数据