分配

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASSIGN

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见分配。

自适应签名选择与集成(分配)

Bioconductor版本:3.15

ASSIGN是一种计算工具，用于评估个体患者样本中通路解除管制/激活状态。ASSIGN采用灵活的贝叶斯因子分析方法，将从基于知识的文献或扰动实验中获得的预定途径特征适应为细胞/组织特异性途径特征。每个情境特定通路的解除管制/激活水平被量化为一个分数，该分数代表了患者样本包含通路解除管制/激活特征的程度。

作者:沈颖，Andrea H. Bild, W. Evan Johnson, Mumtehena Rahman

维护人员:沈颖， W. Evan Johnson < wejat bu.edu>， David Jenkins < dfjat bu.edu>， Mumtehena Rahman

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ASSIGN")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“转让”)

超文本标记语言	R脚本	底漆
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，GeneExpression，通路，软件
版本	1.32.0
在Bioconductor中	BioC 2.14 (R-3.1)(8.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4)
进口	gplots、图形、grDevices、二甲基砜，Rlab统计数据,股东价值分析跑龙套,ggplot2，yaml
链接
建议	testthat，BiocStyle，lintr，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://compbiomed.github.io/ASSIGN/
BugReports	https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues
这取决于我
进口我	TBSignatureProfiler
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	ASSIGN_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	ASSIGN_1.32.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ASSIGN_1.32.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ASSIGN
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ASSIGN/
软件包下载报告	下载数据