萤石

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAnD

这个包是版本3.15的Bioconductor。这个包已经从生物导体公司拿走了。有关最新的稳定发布版本，请参见萤石．

执行染色体血统差异(CAnD)分析

Bioconductor版本:3.15

对一组祖先比例执行CAnD测试的函数。对于特定的祖先亚群，用户将提供每个样本的估计祖先比例，以及每个染色体或感兴趣的染色体片段。每条染色体的p值以及总体c和p值将为每次测试返回。绘图功能也可用。

作者:凯特琳·麦克休，蒂莫西·桑顿

维护者:Caitlin McHugh < mchough@uw.edu >

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CAnD")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“萤石”)

PDF	R脚本	利用“CAnD”包检测跨染色体群体结构的异质性
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneticVariability，遗传学，单核苷酸多态性，软件，StatisticalMethod
版本	1.27.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,ggplot2，重塑
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	CAnD_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	CAnD_1.27.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CAnD_1.27.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/CAnD
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/CAnD
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CAnD/
软件包下载报告	下载数据