生物导体版本:版本(3.15)
CellMix提供指标和功能,以评估单细胞分辨率的单细胞trancriptom数据中的批次效应,数据集成和批处理效应校正。可以在不同级别上可视化和总结结果,例如在单元格,细胞类型或数据集级别上。
作者:AlmutLütge[AUT,CRE]
维护者:uzh.ch>almutLütge
引用(从r内,输入引用(“ CellMixs”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CellMixs”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CellMixs”)
html | R脚本 | 探索数据集成和批处理效果 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 批处理效应,,,,基因表达,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(3年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | ksamples,R(> = 4.0) |
进口 | 生物脑,,,,GGPLOT2,,,,评分,,,,维里迪斯,,,,牛仔图,,,,总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,花花公子,,,,马格里特,,,,dplyr,,,,Ggridges,统计purrr, 方法,生物比较,,,,生物基因 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,林玛,,,,RTSNE |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/almutlue/cellmixs |
BugReports | https://github.com/almutlue/cellmixs/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cellmixs_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | cellmixs_1.12.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | cellmixs_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellmixs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellmixs |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cellmixs/ |
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