细胞混蛋

doi:10.18129/b9.bioc.cellmixs

评估细胞特异性混合

生物导体版本:版本(3.15)

CellMix提供指标和功能,以评估单细胞分辨率的单细胞trancriptom数据中的批次效应,数据集成和批处理效应校正。可以在不同级别上可视化和总结结果,例如在单元格,细胞类型或数据集级别上。

作者:AlmutLütge[AUT,CRE]

维护者:uzh.ch>almutLütge

引用(从r内,输入引用(“ CellMixs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ CellMixs”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ CellMixs”)

html R脚本 探索数据集成和批处理效果
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 批处理效应,,,,基因表达,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 GPL(> = 2)
要看 ksamples,R(> = 4.0)
进口 生物脑,,,,GGPLOT2,,,,评分,,,,维里迪斯,,,,牛仔图,,,,总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,花花公子,,,,马格里特,,,,dplyr,,,,Ggridges,统计purrr, 方法,生物比较,,,,生物基因
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,林玛,,,,RTSNE
系统要求
增强
URL https://github.com/almutlue/cellmixs
BugReports https://github.com/almutlue/cellmixs/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cellmixs_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 cellmixs_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cellmixs_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellmixs
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellmixs
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cellmixs/
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