EpiTxDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiTxDb

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见EpiTxDb。

使用AnnotationDbi接口存储和访问表转录组信息

Bioconductor版本:3.15

EpiTxDb促进了表转录组信息的存储。更具体地说，它可以跟踪修饰的身份，位置，将其引入RNA的酶，确定要修饰的RNA上的位置以及每个修饰相关的文献参考的指示符。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, re]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm. gm。恩斯特在outlook.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("EpiTxDb")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“EpiTxDb”)

超文本标记语言	R脚本	EpiTxDb
超文本标记语言	R脚本	EpiTxDb-creation
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	Epitranscriptomics，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，AnnotationDbi，Modstrings
进口	方法,跑龙套,httr，xml2，旋度，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomeInfoDb，BiocGenerics，BiocFileCache，S4Vectors，IRanges，RSQLite，DBI，Biostrings，tRNAdbImport
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，httptest，AnnotationHub，ensembldb，ggplot2，EpiTxDb.Hs.hg38，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb
BugReports	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/issues
这取决于我	EpiTxDb.Hs.hg38，EpiTxDb.Mm.mm10，EpiTxDb.Sc.sacCer3
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	EpiTxDb_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	EpiTxDb_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	EpiTxDb_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/EpiTxDb
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/EpiTxDb
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/EpiTxDb/
软件包下载报告	下载数据