辛格

doi：10.18129/b9.bioc.singler

基于参考的单细胞RNA-seq注释

生物导体版本：版本（3.15）

通过利用纯细胞类型的参考转录组数据集来独立推断每个单个单元的原点细胞，从而从单细胞RNA测序数据中执行无偏的细胞类型识别。

作者：Dvir Aran [AUT，CPH]，Aaron Lun [CTB，CRE]，Daniel Bunis [CTB]，Jared Andrews [CTB]，FriederikeDündar[CTB]

维护者：aaron lun

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Singler”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Singler”）

html	R脚本	注释SCRNA-SEQ数据
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	注解，，，，分类，，，，聚类，，，，基因表达，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（3年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	总结性特征
进口	方法，矩阵，，，，S4VECTORS，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，生物脑，，，，生物比较，，，，生物兴奋，统计，utils，RCPP，，，，beachmat， 平行
链接	RCPP，，，，beachmat
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，生物基因，，，，Singlecellexperiment，，，，砍伐，，，，评分，，，，斯克兰，，，，scrnaseq，，，，GGPLOT2，，，，pheatmap，grdevices，栅格，，，，维里迪斯，，，，CellDex
系统要求	C ++ 11
增强
URL	https://github.com/ltla/singler
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我	奥斯卡。
进口我	Singlecelltk
建议我	tidysinglecellexperiment
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Singler_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	singler_1.10.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Singler_1.10.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singler
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/新人
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/singler/
软件包下载报告	下载统计