bigmelon

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmelon

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见bigmelon．

用于大型实验的Illumina甲基化阵列分析

Bioconductor版本:3.15

使用gdsfmt处理Illumina阵列的方法。

作者:Tyler J. Gorrie-Stone, Ayden Saffari, Karim Malki, Leonard C. Schalkwyk

维护者:Tyler J. Gorrie-Stone < Tyler。Gorrie-stone, diamond.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") biomanager::install("bigmelon")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“bigmelon”)

PDF	R脚本	大甜瓜包装
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CpGIsland，DNAMethylation，DataImport，MethylationArray，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.22.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，西瓜(> = 1.25.0),gdsfmt(>= 1.0.4)，方法minfi(> = 1.21.0),Biobase，methylumi
进口	属性,跑龙套,GEOquery、图形、BiocGenerics，illuminaio
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，BiocStyle，minfiData平行,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，bumphunter
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	bigmelon_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	bigmelon_1.22.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	bigmelon_1.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bigmelon
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bigmelon/
软件包下载报告	下载数据