biomvRCNS

DOI:10.18129 / B9.bioc.biomvRCNS

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见biomvRCNS．

多变量生物数据的拷贝数研究与分割

Bioconductor版本:3.15

在这个包中，设计并实现了一个隐藏半马尔可夫模型(HSMM)和一个均匀分割模型，用于分割基因组数据，目的是协助使用高通量技术(如RNA-seq或平纹阵列)进行转录本检测，以及使用aCGH或测序进行拷贝数分析。

作者:杨度

维护者:杨杜

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("biomvRCNS")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“biomvRCNS”)

PDF	R脚本	biomvRCNS包介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，遗传学，微阵列，测序，软件，可视化，aCGH
版本	1.36.0
在Bioconductor中	BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5.0)，IRanges，GenomicRanges，Gviz
进口	方法,mvtnorm
链接
建议	集群平行,GenomicFeatures，dynamicTreeCut，Rsamtools，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	biomvRCNS_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	biomvRCNS_1.36.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	biomvRCNS_1.36.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/biomvRCNS
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/biomvRCNS
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/biomvRCNS/
软件包下载报告	下载数据