咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

此包适用于Bioconductor 3.15版;有关稳定的最新发布版本,请参见咆哮

生物导体的聚类算法

Bioconductor版本:3.15

将常见的聚类算法封装在易于扩展的S4框架中。后端实现了分层、k-means和基于图的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre], Stephanie Hicks [ctb]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“咆哮”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“咆哮”)

超文本标记语言 R脚本 1.聚类算法
超文本标记语言 R脚本 2.聚类诊断
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpressionImmunoOncologySingleCell软件转录组
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 统计,方法,效用,集群矩阵RcppigraphS4VectorsBiocParallelBiocNeighbors
链接 Rcpp
建议 knitrrmarkdowntestthatBiocStyledynamicTreeCutscRNAseq天窗食物pheatmap冬青mbkmeanskohonenapcluster
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我 OSCA。先进,OSCA。basic, OSCA.intro, OSCA。multisample, OSCA.workflows
进口我 scDblFinder食物
建议我 后面;ChromSCapedittoSeqmbkmeansmumosa
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 bluster_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 bluster_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) bluster_1.6.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bluster
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/bluster/
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