glmGamPoi

DOI:10.18129 / B9.bioc.glmGamPoi

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见glmGamPoi。

拟合Gamma-Poisson广义线性模型

Bioconductor版本:3.15

拟合线性模型，以过度分散的计数数据。该包可以估计过色散和拟合矩阵输入的重复模型。它被设计用于处理大型输入数据集，因为它们通常发生在单细胞RNA-seq实验中。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze[作家，作家]——迈克尔·洛夫

维护者:Constantin Ahlmann-Eltze

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("glmGamPoi")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“glmGamPoi”)

超文本标记语言	R脚本	glmGamPoi快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	RNASeq，回归，SingleCell，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp，DelayedMatrixStats，matrixStats，DelayedArray，HDF5Array，SummarizedExperiment，BiocGenerics，方法，统计，utils，样条
链接	Rcpp，RcppArmadillo，beachmat
建议	testthat(> =魅惑,动物园，DESeq2，刨边机，limma，beachmat，质量，statmod，ggplot2，板凳上，BiocParallel，knitr，rmarkdown，BiocStyle，TENxPBMCData，muscData，食物
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/const-ae/glmGamPoi
BugReports	https://github.com/const-ae/glmGamPoi/issues
这取决于我
进口我	transformGamPoi
建议我	DESeq2
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	glmGamPoi_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	glmGamPoi_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	glmGamPoi_1.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/glmGamPoi
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/glmGamPoi
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/glmGamPoi/
软件包下载报告	下载数据