rhdf5

DOI:10.18129 / B9.bioc.rhdf5

这个包是版本3.15的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见rhdf5．

R HDF5接口

Bioconductor版本:3.15

这个包提供了HDF5和r之间的接口。HDF5的主要特性是能够通过完全可移植的文件格式在大容量存储器(磁盘)上存储和访问非常大和/或复杂的数据集和各种各样的元数据。因此，rhdf5包适合于在R和其他软件包之间交换大型和/或复杂的数据集，也适合于让R应用程序处理大于可用RAM的数据集。

作者:Bernd Fischer [aut]， Mike Smith [aut, cre]、格雷瓜尔·保罗、马丁·摩根、丹尼尔·范·特维斯克

维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在英国

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rhdf5")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“rhdf5”)

超文本标记语言	R脚本	在云端读取HDF5文件
超文本标记语言	R脚本	HDF5 - HDF5接口为R
超文本标记语言	R脚本	rhdf5实用技巧
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	2.40.0
在Bioconductor中	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 4.0.0)，方法
进口	Rhdf5lib(> = 1.13.4),rhdf5filters
链接	Rhdf5lib
建议	bit64，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，微基准测试，dplyr，ggplot2，嘲笑
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://github.com/grimbough/rhdf5
BugReports	https://github.com/grimbough/rhdf5/issues
这取决于我	GenoGAM，GSCA，HDF5Array，HiCBricks，LoomExperiment，MuData
进口我	BayesSpace，BgeeCall，biomformat，bnbc，bsseq，CiteFuse，cmapR，CoGAPS，CopyNumberPlots，CRISPRseek，cTRAP，cytomapper，diffHic，DmelSGI，DropletUtils，epigraHMM，EventPointer，弗雷泽，GenomicScores，gep2pep，h5vc，HiCcompare，电离，MafH5.gnomAD.v3.1.1.GRCh38，MafH5.gnomAD.v3.1.2.GRCh38，MethylSeqData，MOFA2，NxtIRFcore，phantasus，ptairData，ptairMS，PureCN，recountmethylation，ribor，scCB2，司康饼，signatureSearch，signatureSearchData，trackViewer
建议我	刨边机，rhdf5filters，SCArray，激流回旋，光谱，SummarizedExperiment，tximport，zellkonverter
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	rhdf5_2.40.0.tar.gz
Windows二进制	rhdf5_2.40.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	rhdf5_2.40.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rhdf5
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rhdf5/
软件包下载报告	下载数据